黄瓜绿斑驳花叶病毒抗原表位预测

• 作者: 任静 孙立娜 张杰 杨洪一
• 来源期刊: 河南农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 黄瓜绿斑驳花叶病毒 抗原表位 系统进化分析 蛋白结构
• 年，卷（期）: 2013,（8）
• 所属期刊栏目: 植物保护
• 页码范围: 67-70
• 页数: 4页
• 分类号: S436.421.1
• 字数: 2668字
• 语种: 中文

摘要

探索通过生物信息学方法预测黄瓜绿斑驳花叶病毒(cucumber green mottle mosaic virus,CGMMV)的抗原表位,为基于抗原表位策略制备CGMMV抗血清打下基础.利用MEGA软件中的邻近算法对CGMMV进行系统进化分析,结果显示,不同CGMMV分离物可分为2个类群,不同分离物间未见明显的寄主相关性和地理相关性.应用不同生物信息学软件对CGMMV外壳蛋白不同区域的抗原指数、蛋白二级结构进行分析,结合外壳蛋白三级结构预测结果综合分析,CGMMV外壳蛋白抗原表位区可能位于N端3-15、80-90、90-100位氨基酸残基附近.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张杰		119	1047	18.0	28.0
3	孙立娜		14	21	3.0	3.0
4	杨洪一		4	14	3.0	3.0
7	任静		30	186	8.0	12.0