漳州西施舌线粒体基因组全序列:腔蛤蜊属(Coelomactra)存在新种的证据

• 作者: 孟学平 梁猛 田美 申欣 程汉良 董志国 赵娜娜 郝珏 阎斌伦
• 来源期刊: 海洋学报（中文版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 西施舌 线粒体基因组 遗传差异 新种
• 年，卷（期）: 2013,（3）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 204-214
• 页数: 11页
• 分类号: Q959.215
• 字数: 7240字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0253-4193.2013.03.024

摘要

利用长PCR扩增漳州西施舌线粒体DNA(ZZ-mtDNA),用引物步移法测序,获得线粒体基因组DNA全序列,研究其基因组特点.结合双壳类49个物种线粒体全基因组,分析基因间核苷酸和蛋白质氨基酸序列的差异,构建系统进化树,探讨漳州西施舌系统演化地位.研究结果表明:漳州西施舌线粒体基因组DNA全长17 199 bp,A+T含量为64.2％,编码36个基因,其中12个蛋白质编码基因,22个转运RNA基因(tRNAs),2个核糖体RNA基因(lrRNA和srRNA),全部基因均位于重链上,tRNASer为单拷贝,tRNAMet为双拷贝；非编码区占10.9％(1882bp/17 199 bp),其中,主非编码区为882 bp,与RZ-mtDNA主非编码区差异明显,另有一个较大(400 bp)的非编码区为漳州西施舌特异性非编码区；以双壳纲帘蛤目文蛤属3种贝类、贻贝目贻贝属4种贝类、珍珠贝目牡蛎科的6种贝类为参照,对编码基因的核苷酸序列和蛋白质氨基酸序列进行差异分析显示,漳州西施舌与日照西施舌达到了种间差异水平.线粒体基因组编码的基因、tRNA组成、非编码区均揭示漳州西施舌是腔蛤蜊属的一个新种.