立枯丝核菌不同融合群菌株GPD 基因的克隆及序列特征分析

• 作者: 任衍春 姜华 孙国昌 张震 杜新法 柴荣耀 毛雪琴 王教瑜 王艳丽 邱海萍
• 来源期刊: 中国水稻科学
• 学科: 农学
• 关键词: 立枯丝核菌 GPD 基因 克隆 进化分析 融合群
• 年，卷（期）: 2013,（6）
• 页码范围: 639-646
• 页数: 8页
• 分类号: Q755|S435.111.4+6
• 字数: 5021字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-7216.2013.06.011

摘要

利用同源克隆的方法对11个立枯丝核菌标准融合群菌株的GPD 基因进行了分离.分析发现不同融合群立枯丝核菌GPD 基因在外显子数目、编码蛋白长度及内含子剪切方式等方面存在差异，如 AG-2-2ⅢB、AG-2-2Ⅳ、AG-8三个融合群的GPD 基因的外显子个数为10个，其他融合群均为11个；AG-8融合群的GPD 基因的编码蛋白长度为267个氨基酸，其余融合群的GPD 基因的编码蛋白长度约为340个氨基酸.AG-2-2ⅢB、AG-2-2Ⅳ、AG-8三个融合群的GPD 基因在98、98、272氨基酸位点的内含子发生了缺失.基于蛋白序列的进化分析表明不同融合群之间GPD 基因编码蛋白存在明显差异，可以有效地将不同融合群菌株区分开来；同时，不同物种之间GPD 基因在进化上仍具有一定保守性，立枯丝核菌自身的GPD基因蛋白序列归为一类且与担子菌门同源性最高.这些结果表明进行保守基因序列差异分析是进行立枯丝核菌分类分群研究的新思路.