盐藻小G蛋白基因(DsRab)的克隆及在高盐胁迫下的表达分析

• 作者: 余祝君 张婷 张晓琳 柴晓杰 薛飞
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 杜氏盐藻 小G蛋白基因 RACE技术 生物信息学 荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2013,（9）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 77-83
• 语种: 中文

摘要

采用RT-PCR和RACE技术扩增了杜氏盐藻小G蛋白基因cDNA全长序列(GenBank Accession No.JN989548),命名为DsRab,对其进行生物信息学分析,并通过实时荧光定量PCR方法检测盐胁迫下该基因的表达情况.结果表明,DsRab基因的cDNA全长为1 299bp,开放阅读框(ORF)为612 bp,编码203个氨基酸,5’非编码区78 bp,3 '非编码区609 bp;保守性结构域分析可知编码的小G蛋白有4个GTP/GDP保守结构域,1个效应区、1个羧基端的半胱氨酸结构域和5个Rab亚家族共有的结构域;二级结构预测表明该蛋白有32.02％的α-螺旋,23.65％的伸展片段,44.33％的自由卷曲,三维建模成功;比对分析发现DsRab蛋白与多种生物的Ypt/Rab的氨基酸序列具有较高的同源性.荧光定量PCR结果表明,盐藻在高盐(3.0 mol/L)胁迫下,DsRab基因表达量显著上调,1h后表达量达到最大值,为正常培养下对照组(0h)的4.9倍,差异极显著(P＜0.01).

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	柴晓杰	大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室辽宁省海洋生物资源恢复与生境修复重点实验室	12	39	4.0	5.0
2	张婷	大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室辽宁省海洋生物资源恢复与生境修复重点实验室	5	26	3.0	5.0
3	余祝君	大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室辽宁省海洋生物资源恢复与生境修复重点实验室	2	8	1.0	2.0
4	张晓琳	大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室辽宁省海洋生物资源恢复与生境修复重点实验室	4	14	2.0	3.0