辣椒 GH3基因的电子克隆与生物信息学分析

• 作者: 杨柏云 熊冬金 罗丽萍 罗火林
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 辣椒 GH3基因 电子克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2013,（6）
• 页码范围: 24-29
• 页数: 6页
• 分类号: Q78
• 字数: 3537字
• 语种: 中文

摘要

利用电子克隆技术获得1个辣椒GH3同源基因的cDNA序列，采用生物信息学方法，对该基因所编码的氨基酸从理化性质、分子进化、跨膜结构域、高级结构等多角度进行分析。结果表明，该基因cDNA全长2140 bp，其开放阅读框为1791 bp，编码595个氨基酸。编码蛋白含32个磷酸化位点，无信号肽，无跨膜区域，是定位在叶绿体上的亲水性蛋白。通过氨基酸序列比对发现，辣椒GH3蛋白与拟南芥、大豆、烟草、番茄等植物中的GH3蛋白同源性较高。为该基因的基因功能研究提供了理论依据。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	罗丽萍	南昌大学生命科学与食品工程学院	107	1459	24.0	33.0
2	杨柏云	南昌大学生命科学与食品工程学院	67	784	18.0	25.0
3	熊冬金	南昌大学生命科学与食品工程学院	28	178	7.0	12.0
4	罗火林	南昌大学生命科学与食品工程学院	22	48	4.0	5.0