基于线粒体COI基因序列的5种鲤养殖品种遗传多样性研究

• 作者: 单云晶 孙效文 张明昭 李超 顾颖 鲁翠云
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 鲤养殖品种 遗传多样性 DNA条形码 COI基因
• 年，卷（期）: 2013,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 931-938
• 页数: 8页
• 分类号: S917
• 字数: 5376字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1118.2013.00931

摘要

本研究通过对5个鲤养殖品种即高寒鲤(Cyprinus carpio Frigid carp)、松浦鲤(Cyprinus carpio Songpu carp)、蓝鳞鲤(Cyprinus carpio blue var)、松浦镜鲤(Cyprinus carpio Songpu mirror carp)和红镜鲤(Cyprinus carpio Red mirror carp)的线粒体COI基因部分序列的测定,比较并分析了其遗传多样性和系统进化关系。在5个鲤品种共100个样本的线粒体COI序列中检测到8种单倍型,其中5个单倍型(H1、H2、H4、H5、H6)涵盖样本较多,占总样本数的94.06%。蓝鳞鲤的单倍型数最少,仅有1个,红镜鲤单倍型数为2个,其余3个品种的单倍型数均为5个。5个品种单倍型多样性(Hd)在0.160±0.070~0.811±0.055,其中,遗传多样性最高的为高寒鲤。AMOVA 结果表明,品种间变异(50.28%)略高于品种内变异(49.72%),各品种间的FST值在0.7114~0.8312,其中蓝鳞鲤与其他群体之间差异最大。用 MEGA4.0软件构建的基于遗传距离的进化树表明,5个养殖品种中,高寒鲤和红镜鲤的遗传距离最近(D=0.31),聚为一支；松浦镜鲤和松浦鲤的遗传距离较近(D=0.33),聚为一支；蓝鳞鲤与其他品种存在较大遗传差异,单独形成一个分支。除蓝鳞鲤外,其余4个养殖品种间均存在共享的单倍型(H2、H4、H5、H6),可能是由于其在选育过程中亲本的遗传背景存在交叉,同时也证明 DNA 条码在分析种内品种间遗传关系时具有可行性但具有一定的局限性。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李超	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	31	177	7.0	11.0
2	鲁翠云	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	47	1092	18.0	32.0
3	顾颖	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	3	33	3.0	3.0
4	张明昭	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	3	33	3.0	3.0
5	单云晶	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	2	26	2.0	2.0