三角帆蚌钙网蛋白基因cDNA的分子特征与表达分析

• 作者: 夏秀琳 李家乐 汪桂玲 白志毅
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 三角帆蚌 钙网蛋白 分子特征 实时荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2013,（5）
• 页码范围: 679-687
• 分类号: Q785|S917.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1231.2013.38454

摘要

为研究淡水珍珠形成相关基因及调控机理,以三角帆蚌为研究对象,借助cDNA末端快速扩增(RACE)技术获得了三角帆蚌的钙网蛋白基因(calreticulin,HcCRT) cDNA序列,该序列长1 437 bp,包含231 bp的5'非编码区(untranslated region,UTR)和615 bp 3'UTR以及591bp的开放阅读框(ORF),共编码196个氨基酸残基,包含一段由21个氨基酸组成的信号肽和一段由175个氨基酸的成熟肽,分子量约为22.4 ku,理论等电点5.01.氨基酸序列分析表明,该序列不存在跨膜结构,疏水性分析显示该蛋白整体为亲水性蛋白.氨基酸列比对分析显示,HcCRT具有保守的钙网蛋白家族结构,具有2个保守的钙网蛋白家族标签序列:KHEQNIDCGGGYLKVF和IMFGPDICG,与其他已知物种的CRT具有较高保守性,其中与斑马鱼的相似度为77％,与长牡蛎和马氏珠母贝的相似度为70％.对三角帆蚌HcCRT蛋白序列的二级结构和三级结构进行预测分析,显示该蛋白同时含螺旋和折叠.实时荧光定量PCR分析结果显示,HcCRT在外套膜、血液、鳃、斧足、肝脏、肾脏、肠和闭壳肌等8个组织中均有表达,其中在外套膜中表达量最高,血液次之,在其他组织的表达量极少.初步推测HcCRT参与了三角帆蚌珍珠形成的生物矿化过程.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	白志毅	上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室	36	253	9.0	14.0
2	汪桂玲	上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室	33	196	9.0	12.0
3	夏秀琳	上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室	1	5	1.0	1.0