缢蛏丝氨酸蛋白酶基因的序列特征及其表达分析

• 作者: 李家乐 牛东红 王劦 金凯
• 来源期刊: 上海海洋大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 缢蛏 丝氨酸蛋白酶 序列分析 基因表达
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 水产生物技术
• 页码范围: 481-487
• 分类号: S917
• 语种: 中文

摘要

含有clip结构域的丝氨酸蛋白酶是一类新的丝氨酸蛋白酶家族,可能参与非特异性免疫防御功能.从缢蛏(Sinonovacula constricta)cDNA文库中筛选出一条丝氨酸蛋白酶同源EST序列,然后通过5'RACE扩增、测序,拼接得到全长为1 228 bp的cDNA序列,包括66 bp的5’非翻译区和160 bp的3’非翻译区,以及1 002 bp的开放阅读框.阅读框共编码333个氨基酸,含有17个氨基酸的信号肽序列,并含有发卡结构域(clip domain)和胰蛋白酶样丝氨酸蛋白酶结构域(Tryp_SPc domain).在clip结构域中包含6个半胱氨酸残基形成的3个二硫键,在Tryp_SPc结构域中包含His-Asp-Ser催化三联体(HDS).该缢蛏丝氨酸蛋白酶基因被命名为ScSP.实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析表明,ScSP在缢蛏的外套膜、水管、鳃、斧足、性腺、肝胰腺6个组织中均有表达,尤其在肝胰腺中表达显著高于其他组织,其次为性腺组织,而水管,外套膜和鳃中表达量最低.缢蛏经鳗弧菌(Vibrio anguillarum诱导感染后4h和8h,肝胰腺中的ScSP基因表达量显著上调.缢蛏丝氨酸蛋白酶的序列特征与表达分析揭示了ScSP是含有clip结构域的丝氨酸蛋白酶基因,参与了非特异性免疫防御,为进一步研究该基因的结构和功能奠定了基础.研究亮点:丝氨酸蛋白酶基因在双壳贝类中研究较少,本文获得的序列具有丝氨酸蛋白酶基因所特有的clip发夹域和胰蛋白酶样结构域,确定为丝氨酸蛋白酶基因.该基因在肝胰腺中的表达量显著高于其他组织,而且经鳗弧菌诱导后其表达量出现了显著上调,可能参与缢蛏的非特异性免疫.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	牛东红	上海海洋大学农业部水产种质资源重点实验室	27	216	10.0	14.0
2	金凯	上海海洋大学农业部水产种质资源重点实验室	1	6	1.0	1.0
3	王劦	上海海洋大学农业部水产种质资源重点实验室	1	6	1.0	1.0