桂林地区麻鸭DHBV基因全长克隆和序列分析以及DHBV定量检测方法的建立

• 作者: 何松青 刘永明 刘青波 徐庆 朱华 苏何玲 莫之婧 黄日东
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 医学
• 关键词: 鸭乙型肝炎病毒 序列分析 荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2013,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 180-184
• 页数: 5页
• 分类号: R373.2+1
• 语种: 中文

摘要

携带鸭乙肝病毒(DHBV)麻鸭作为乙肝动物模型被广泛应用于抗HBV药物活性和毒性研究,广西桂林地区麻鸭具有较高的DHBV携带率,但其DHBV基因组结构特点尚未见报道.本研究克隆了桂林麻鸭DHBV基因组,其序列全长3 027bp,ORF finder分析发现桂林麻鸭DHBV除具有S、P、C开放阅读框架外,还有一编码未知多肽的开放阅读框架,Vector NTI 8.0分析显示该多肽具有与HLA* 0201结合的模体结构.比对不同国家及地区DHBV序列,并以Mega5.0生成进化树提示DHBV序列差异无明显的地域分布特点.以所构建的DHBV S基因重组质粒pGEM-DHBV-S为标准品,建立了荧光定量PCR检测DHBV方法.本研究结果为应用桂林麻鸭作为乙肝动物模型奠定了实验基础.