常用系统发育树构建算法和软件鸟瞰

• 作者: 何彬 何远 关琼 刘佳妮 张丽娜 朱兴文 荣昌鹤 陈红菊
• 来源期刊: 动物学研究
• 学科: 生物学
• 关键词: 系统发育树 距离矩阵法 最大简约法 最大似然法 贝叶斯算法 系统发育分析软件
• 年，卷（期）: 2013,（6）
• 所属期刊栏目: 综述
• 页码范围: 640-650
• 分类号: Q332
• 语种: 中文
• DOI: 10.11813/j.issn.0254-5853.2013.6.0640

摘要

系统发育树又称进化树、生命树等,在达尔文的“进化论”一书中首次出现,之后系统发育树的重构被广大生物学家所接受.该文阐述了构建系统发育树的基本流程,对目前用于构建系统发育树的四类算法(距离法、最大简约法、最大似然法和贝叶斯法)进行了详细地分析和比较,并介绍了一些常用系统发育树构建和分析软件(PHYLIP、MEGA、MrBayes)的特点.