日本文昌鱼ZP蛋白氨基酸序列多样性的初步研究

• 作者: 王忠军 许强华
• 来源期刊: 上海海洋大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 日本文昌鱼 ZP蛋白 ZP结构域 序列多样性
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 水产生物技术
• 页码范围: 502-509
• 分类号: S917
• 语种: 中文

摘要

ZP蛋白家族是一类具有相对保守的ZP结构域的蛋白质,通常在精卵结合过程中起作用.从日本文昌鱼(Branchiostoma japonicum)中发现一种编码927个氨基酸残基的ZP蛋白cDNA.利用SMART预测该ZP蛋白序列含有3个结构域:透明带结构域、跨膜结构域以及低复杂度区域.利用该ZP基因的整个开放阅读框,检测该基因在日本文昌鱼群体中的氨基酸序列多样性.研究结果发现,在9个日本文昌鱼个体中扩增获得序列长度为2 481 ～2 784 bp,编码826～ 927个氨基酸.氨基酸序列比对显示,存在55个变异位点,占总氨基酸残基数的5.93％(55/927),其中有2个个体的氨基酸序列分别存在9个和101个氨基酸残基的缺失,这可能与ZP基因的不同剪切有关.揭示了日本文昌鱼ZP蛋白序列多样性可能与该蛋白的结构与功能多样性具有一定的相关性.研究亮点:通过质谱比对分析和设计引物第一次克隆得到日本文昌鱼的ZP基因,分析了该ZP基因的氨基酸结构域,其具有约249个氨基酸残基的典型ZP结构域.通过扩增日本文昌鱼不同个体之间的ZP基因,发现该ZP基因编码的氨基酸序列在日本文昌鱼不同个体之间是存在差异的.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王忠军	上海海洋大学海洋科学学院	1	1	1.0	1.0