染色质免疫沉淀-测序:全基因组范围研究蛋白质-DNA相互作用的新技术

• 作者: 徐柯 曾朝阳 李俏 李桂源 梁芳 熊炜 马健 龚朝建
• 来源期刊: 生物化学与生物物理进展
• 学科: 生物学
• 关键词: ChIP-seq 新一代测序技术 基因调控 表观遗传学 数据分析
• 年，卷（期）: 2013,（3）
• 所属期刊栏目: 综述与专论
• 页码范围: 216-227
• 页数: 12页
• 分类号: Q78|Q81
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1206.2012.00305

摘要

染色质免疫沉淀-测序(ChIP-seq)是近年来新兴的将染色质免疫沉淀(ChIP)与深度测序技术相结合,在全基因组范围内分析DNA结合蛋白结合位点、组蛋白修饰、核小体定位和DNA甲基化的高通量技术.在新一代测序(NGS)技术的大力推动下,ChIP-seq提供了一种相对于ChIP-chip高分辨率、低噪音、高覆盖率的研究方法.随着测序成本的降低,ChIP-seq逐步成为研究基因调控和表观遗传机制的一种常用手段.本文就该技术的最近研究进展进行综述,并着重介绍ChIP-seq数据分析过程及该技术的实际应用情况.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李桂源		148	1383	17.0	30.0
2	熊炜		26	101	6.0	9.0
3	曾朝阳		13	85	4.0	9.0
4	龚朝建		12	78	6.0	8.0
5	马健		11	66	3.0	8.0
6	梁芳		12	63	4.0	7.0
7	李俏		3	0	0.0	0.0
8	徐柯		2	0	0.0	0.0