香蕉幼果SSH文库构建及初步分析

• 作者: 冯素萍 武耀廷 王静毅 陈友 颜园园
• 来源期刊: 果树学报
• 学科: 农学
• 关键词: 皇帝蕉 果实发育 抑制差减杂交 cDNA文库
• 年，卷（期）: 2013,（3）
• 所属期刊栏目: 种质资源·遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 373-380
• 页数: 8页
• 分类号: S668.1
• 语种: 中文

摘要

[目的]构建香蕉果实发育抑制差减文库,筛选果实发育相关基因.[方法]以皇帝蕉幼果为实验组,幼叶为对照组,构建差减文库,并用Blast2GO软件进行生物信息学分析.[结果]挑选982个重组子菌液PCR筛选cDNA文库,得到750个候选克隆.对其中200个克隆进行测序、去载体序列、拼接后,获得92个unigenes.在GenBank中进行同源性比较,共有81个找到同源序列,11个cDNA未找到同源序列.75个unigenes在GO数据库中有功能注释,涉及到的细胞组分、分子功能和生物过程分别为53个、72个和60个,显示果实发育差异主要与在细胞内部组分进行的代谢过程的强度,以及其他一些因子和激酶的影响有关.[结论]成功构建皇帝蕉果实的差减cDNA文库,为进一步开展香蕉果实发育相关基因如tubulin、P450等基因的克隆及功能鉴定奠定了重要基础.