马铃薯Y病毒pipo基因的分子变异及结构特征分析

• 作者: 史凤阳 常飞 沈建国 詹家绥 谢联辉 高芳銮
• 来源期刊: 遗传
• 关键词: 马铃薯Y病毒 pipo基因 病毒进化
• 年，卷（期）: 2013,（9）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1125-1134
• 页数: 10页
• 字数: 6156字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1005.2013.01125

摘要

为揭示马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)pipo基因的分子变异和结构特征,文章根据文献报道的马铃薯Y病毒属(Potyvirus)pipo基因保守区序列设计一对简并引物,从感染PVY的马铃薯病叶中克隆获得pipo基因的eDNA全长序列,分析其核苷酸序列和氨基酸序列的特征,并基于氨基酸序列使用贝叶斯法重建了Potyvirus的系统发育树.结果显示:20个PVY分离物成功扩增出预期大小(约235 bp)的特异性片段,其核苷酸序列与已报道的其它PVY株系的pipo基因核苷酸序列一致性均在92％以上；5 '端均含有典型的G1-2A6-7基序(motif),无碱基插入/缺失,所有的核苷酸变异都是碱基置换,共发现13个多态性位点,其中4个简约信息位点,9个单一变异位点,表明该基因高度保守,但不同分离物也存在一定的分子变异；PIPO蛋白理论等电点11.26～11.62,无信号肽和跨膜区,是可溶的亲水性蛋白；整个蛋白含有3个保守区,其中位于10～59aa的基序最为保守.该蛋白主要定位于线粒体中,可能是线粒体导肽.系统发育分析结果显示,源于PVY不同株系优先相聚成簇,而向日葵褪绿斑驳病毒(Sunflower chlorotic mottle virus,SuCMoV)与辣椒重花叶病毒(Pepper severe mosaic virus,PepSMV)的亲缘关系较PVY相比更近,与前人的结果相一致,表明PIPO蛋白可以作为研究Potyvirus系统发育关系的新的分子标记.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谢联辉	福建农林大学植物病毒研究所福建省植物病毒学重点实验室	184	3024	29.0	43.0
2	沈建国	福建出入境检验检疫局检验检疫技术中心	45	201	8.0	12.0
3	高芳銮	福建农林大学植物病毒研究所福建省植物病毒学重点实验室	13	92	5.0	9.0
4	史凤阳	福建农林大学植物病毒研究所福建省植物病毒学重点实验室	2	31	2.0	2.0
5	常飞	福建农林大学植物病毒研究所福建省植物病毒学重点实验室	2	31	2.0	2.0
6	詹家绥	福建农林大学植物病毒研究所福建省植物病毒学重点实验室	14	165	7.0	12.0