干旱胁迫下油菜消减文库的构建及分析

• 作者: 张兵 张霞 李加纳 谢小玉 马仲炼
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 油菜 抑制差减杂交 干旱胁迫 cDNA文库 表达序列标签
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 744-752
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2013.00744

摘要

以抗旱能力强的油菜Holiday为材料,以干旱处理的样品为Tester,正常水分管理(对照)为Driver构建干旱诱导的甘蓝型油菜叶片正向抑制性消减杂交(SSH)文库.随机挑选24个阳性克隆进行PCR验证,结果表明,其中23个含有插入片段,平均大小在750 bp左右.将96个阳性克隆测序,运用CAP3 Sequence Assembly Program聚类、拼接和去除冗余,获得重叠群4条,单拷贝序列82条,平均长度为542 bp.经BlastX程序比对蛋白数据库发现,11条EST没有找到同源性序列,75条有同源序列.KOBAS分析发现,28条EST被定位到67条代谢途径中,根据P值推测,光合中的碳固定、有氧呼吸的电子供体、氮代谢、乙醛酸和二羧酸代谢在植物干旱胁迫中发挥着极为重要的作用.这些EST涉及到的功能中所占比例最大的分别是细胞器(58.82％)、结合(30.77％)和新陈代谢过程(43.72％),表明甘蓝型油菜受到干旱胁迫时,细胞器组件上的功能发挥了重要的作用,结合基因和蛋白被激活,加强了新陈代谢.