TLR9基因SNP位点检测及其在7种鲤中的遗传多样性研究

• 作者: 张秋军 李池陶 柏盈盈 石连玉 葛会争 贾智英
• 来源期刊: 淡水渔业
• 学科: 农学
• 关键词: TLR9基因 SNP 鲤(Cyprinus carpio) 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2013,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 19-28
• 页数: 10页
• 分类号: S917.4
• 字数: 4008字
• 语种: 中文

摘要

采用直接测序法对7种鲤(Cyprinus carpio):德国镜鲤(C.carpio L.mirror)、松荷鲤(C.carpio L)、松浦鲤(C.carpio var.Songpu)、易捕鲤(C.carpio var.Yibu)、大头鲤(C.pellegrini T.)、松浦镜鲤(C.carpio var.Songpu mirror)和野鲤(C.carpio haematoperus)TLR9基因的SNP位点的多态性和遗传多样性进行了研究.结果显示,在292个个体中共检测出37个碱基变异位点,均位于基因外显子区域,占整个片段长度的0.84％,其中20个SNP位点为非同义突变.野鲤的碱基突变位点最多,松浦镜鲤的碱基突变位点最少(P＜0.05),其他各品种间无显著性差异(P＞0.05);野鲤的非同义突变位点最多,松浦镜鲤的非同义突变位点最少(P＜0.05),其他各品种间无显著性差异(P＞0.05).稀有等位基因频率大于0.05时,经Hardy-Weinberg卡方检验结果显示各品种中除了德国镜鲤和松浦镜鲤外,大多数位点都处于平衡状态(P＞0.05);各品种的PIC值处于中低度多态水平(PIC＜0.5).卡方检验分析结果显示,各品种间共有24个位点的基因型频率存在显著性差异(P＜0.05),其中11个位点为非同义突变位点,这可能是影响TLR9基因免疫应答功能的原因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	贾智英	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	40	388	10.0	18.0
2	李池陶	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	74	641	14.0	20.0
3	石连玉	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	63	496	13.0	18.0
4	柏盈盈	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	4	38	4.0	4.0
8	葛会争	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	2	13	2.0	2.0
12	张秋军	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	2	5	1.0	2.0