多位点串联重复序列分析应用于中国肠炎沙门菌分型能力的评价

• 作者: 刁保卫 娄静 李杰 聂艳妮 闫梅英 阚飙
• 来源期刊: 疾病监测
• 学科: 医学
• 关键词: 肠炎沙门菌 脉冲场凝胶电泳 多位点串联重复序列分析 分子分型
• 年，卷（期）: 2013,（12）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 1021-1026
• 分类号: R378.2+2
• 语种: 中文
• DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2013.12.017

摘要

目的 比较脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点串联重复序列分析(MLVA)分型方法用于我国肠炎沙门菌分子分型的能力,建立我国肠炎沙门菌MLVA分型标准操作方法及数据库.方法 根据国际PulseNet公布的肠炎沙门菌PFGE和MLVA分型方案,对来自我国6个省(直辖市)的289株肠炎沙门菌进行分子分型分析,并结合流行病学资料,评价这两种分型方法对我国肠炎沙门菌分离株的分型能力.结果 289株肠炎沙门菌经Xba Ⅰ酶切,PFGE后获得55种带型,其分辨能力(D值)为0.8433.PFGE优势带型为JEGX01.CN0003及JEGX01.CN0001,带型频率分别为35.6％、25.6％,但二者仅表现两个条带的差异,其余型别均低于5％.采用MLVA分析,获得63种型别,分为2个群,D值为0.8608,说明MLVA分辨能力高于单酶切PFGE,但分型能力仍然有限.MLVA主要型别ST1包含了97株菌株,占37.5％,分布于各省及各年份.若联合PFGE及MLVA分型,则产生104种型别,D值为0.9058.对流行病学调查显示为肠炎沙门菌暴发病例菌株进行PFGE双酶切及MLVA分型,结果均显示这些菌株具有明显的聚集性,但不能与同期散发菌株完全区分开.结论 MLVA与PFGE分型方法的分辨能力在肠炎沙门菌中较低,在确认肠炎沙门菌引起的暴发事件时,需紧密结合流行病学调查资料,采用双酶切PFGE或MLVA进行分型分析.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	阚飙	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所	120	614	11.0	19.0
2	李杰	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所	29	166	6.0	12.0
3	刁保卫	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所	33	200	7.0	12.0
4	闫梅英	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所	29	218	6.0	14.0
5	聂艳妮	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所	5	21	3.0	4.0
6	娄静	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所	8	51	5.0	7.0