杨凌番茄黄化曲叶病毒外壳蛋白基因的克隆与其核心序列分析

• 作者: 崔霞 李云洲 李翠 梁燕 王巧丽 秦蕾
• 来源期刊: 中国蔬菜
• 学科: 农学
• 关键词: 番茄黄化曲叶病毒 杨凌番茄黄化曲叶病毒分离物 克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 38-45
• 页数: 8页
• 分类号: S436.412.1+1
• 字数: 3930字
• 语种: 中文

摘要

以陕西杨凌番茄生产基地感病(TYLCV症状)番茄植株为材料,分离得到杨凌番茄黄化曲叶病毒分离物,命名为TYLCV-Yl(GenBank序列号:KC293824,未公布)；克隆该病毒外壳蛋白全基因序列CP及其核心序列tCP；分析核心序列tCP的特征、进化特征；运用DNAMAN多重比较了该病毒外壳蛋白序列与其他18个TYLCV-CP核苷酸序列并且构建了基于CP基因核苷酸序列的进化树.结果表明:获得杨凌番茄黄化曲叶病毒(TYLCV-Yl)分离物,确定杨凌番茄黄化曲叶病毒源；获得TYLCV-Yl CP全基因序列核心序列tCP,为基于CP抗TYLCV奠定基础；tCP核心序列非常保守,长度为419 bp,编码137个氨基酸,其中在79～ 97个氨基酸之间具有1个跨膜结构；基于CP基因构建的进化树可将番茄黄化曲叶病毒分为3个亚组:TYLCV亚组Ⅰ,TYLCV亚组Ⅱ,TYLCV亚组Ⅲ,其中杨凌番茄黄化曲叶病毒(TYLCV-Yl)属于TYLCV亚组Ⅰ.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	梁燕	西北农林科技大学园艺学院	70	645	14.0	22.0
2	李翠	西北农林科技大学园艺学院	17	207	9.0	14.0
3	李云洲	西北农林科技大学园艺学院	11	112	6.0	10.0
4	王巧丽	西北农林科技大学园艺学院	2	9	2.0	2.0
5	崔霞	西北农林科技大学园艺学院	5	97	4.0	5.0
6	秦蕾	西北农林科技大学园艺学院	10	65	3.0	8.0