高通量DNA测序数据压缩研究进展

• 作者: 姜亮 尤著宏 张永朋 朱泽轩 纪震
• 来源期刊: 深圳大学学报（理工版）
• 学科: 工学
• 关键词: 计算机应用 DNA测序 下一代测序 重测序 从头测序 高通量测序 数据压缩算法
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 电子与信息科学
• 页码范围: 409-415
• 页数: 7页
• 分类号: TP391|TP319
• 字数: 5651字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1249.2013.03409

摘要

针对高通量DNA测序技术发展产生的DNA测序数据量猛增,数据压缩技术是解决存储和传输高通量DNA序列数据问题的重要方法之一.评述DNA测序数据传统压缩方法包括替代法和统计法,以及基于参考基因组的高通量DNA测序数据压缩方法,介绍并比较重测序数据压缩、从头测序数据压缩、质量分数压缩和压缩数据检索的代表性算法,研究高通量DNA测序数据压缩面临的挑战及对未来的展望.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	纪震	深圳市嵌入式系统设计重点实验室深圳大学计算机与软件学院	11	16	2.0	3.0
2	姜亮	深圳大学生命科学学院	7	13	2.0	3.0
3	朱泽轩	深圳市嵌入式系统设计重点实验室深圳大学计算机与软件学院	3	10	2.0	3.0
4	张永朋	深圳市嵌入式系统设计重点实验室深圳大学计算机与软件学院	1	3	1.0	1.0
5	尤著宏	深圳市嵌入式系统设计重点实验室深圳大学计算机与软件学院	1	3	1.0	1.0