南美白对虾肠道微生物宏基因组提取方法的比较

• 作者: 叶日英 孙力军 徐德峰 李彩虹 王雅玲
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 南美白对虾 肠道微生物 宏基因组提取
• 年，卷（期）: 2013,（12）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 119-122
• 语种: 中文

摘要

为获得高质量南美白对虾肠道微生物宏基因组模板,采用传统CTAB法、试剂盒和仪器法提取南美白对虾(Penaeus Vanmamei,P.vannamei)肠道微生物宏基因组,通过琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度法和V3区16S rDNA扩增检测所得基因组的完整性、得率、纯度和目的片段质量.结果表明3种方法提取得到的DNA结构均较完整,但得率和纯度差别较大,传统CTAB法提取的DNA得率和纯度均试剂盒和仪器法高,试剂盒和仪器法受糖和盐类污染较高,3种方法提取的宏基因组均可特异扩增出V3区保守片段.综合比较得知传统CTAB法提取P.Vanmamei肠道微生物基因组在完整性、得率和纯度方面优于其他两种方法,可为后续分子生物学分析提供良好基因组模板.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李彩虹	广东医学院生物化学与分子生物学教研室	25	287	7.0	16.0
2	徐德峰	广东省水产品加工与安全重点实验室广东海洋大学食品科技学院	5	31	3.0	5.0
3	孙力军	广东省水产品加工与安全重点实验室广东海洋大学食品科技学院	7	36	3.0	5.0
4	王雅玲	广东省水产品加工与安全重点实验室广东海洋大学食品科技学院	6	32	3.0	5.0
5	叶日英	广东省水产品加工与安全重点实验室广东海洋大学食品科技学院	3	11	2.0	3.0