普通小麦TaDep1基因克隆与特异性标记开发

• 作者: 何中虎 刘亚男 夏先春
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 普通小麦 直立密穗基因 等位变异 基因特异性标记
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 589-598
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2013.00589

摘要

OsDep1 (dense and erect panicle 1)控制水稻产量性状,影响穗长、直立性和着粒密度.根据水稻OsDep1基因序列,采用同源克隆技术克隆了普通小麦第5同源群染色体上的TaDep1基因,它包含5个外显子和4个内含子,与水稻OsDep1基因结构相似.TaDep1-A1、TaDep1-B1和TaDep1-D1的编码序列长度分别为918、888和900 bp,编码305、295和299个氨基酸残基.在普通小麦品种中检测到5个TaDep1-A1等位变异、4个TaDep1-B1等位变异和2个TaDep1-D1等位变异.根据TaDep1-A1和TaDep1-B1位点不同等位变异间的SNP和InDel,开发了3对显性互补标记和1个共显性标记,可以准确鉴别不同等位基因.共显性标记dep19是根据TaDep1-B1第5外显子一个30 bp的InDel开发的,可准确区分TaDep1-B1c与TaDep1-B1a、TaDep1-B1b和TaDep1-B1d.用这些标记对406份小麦品种进行检测,不同基因型的千粒重、株高、穗长、小穗数和穗节间均差异不显著,说明TaDep1基因与我国现有小麦品种的产量性状相关不显著.