草菇TPI基因的克隆、结构及其在同核、异核菌株中的表达量

• 作者: 刘朋虎 江玉姬 谢宝贵 邓优锦
• 来源期刊: 《福建农林大学学报（自然科学版）》
• 关键词: 草菇 磷酸丙糖异构酶 可变剪切 协同增效作用
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 所属期刊栏目: 生命科学
• 页码范围: 63-67
• 页数: 5页
• 分类号: S646.1+3
• 语种: 中文

摘要

分别从不能出菇的草菇单孢菌株PYd21(基因组测序菌株)和PYd15(重测序菌株)及由PYd21、PYd15配对杂交获得可正常出菇的异核菌株H15-21中克隆测序了磷酸丙糖异构酶(TPI)基因,并对TPI基因的结构及其在3个菌株中的表达量进行了分析.结果表明:PYd21、PYd15中TPI基因的序列完全相同；转录组读段定位、双末端分析结果显示,TPI基因全长1015 bp,开放阅读框序列全长756 bp,编码251个氨基酸,有6个外显子、5个内含子；RNA加工过程中存在两种可变剪切类型和两个可变剪切位点；数字基因表达谱测序的结果表明,PYd21、PYd15和H15-21中TPI基因的表达量(TPM)分别为30.25、36.49、77.17,同时通过实时荧光定量PCR分析3个菌株中TPI基因的表达情况证实了该结果,表明草菇中TPI基因的表达表现出异核体表达的协同增效作用,预示着异核菌株中两种不同细胞核存在相互作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谢宝贵	福建农林大学菌物研究中心	186	1536	20.0	28.0
2	江玉姬	福建农林大学菌物研究中心	68	515	13.0	20.0
3	刘朋虎	福建农林大学菌物研究中心	56	275	9.0	14.0
7	邓优锦	福建农林大学菌物研究中心	44	315	12.0	16.0