水稻OsPP6C基因的克隆、过表达载体构建与生物信息学分析

• 作者: 侯佩 吴大付 宋梅芳 方聪燕 李建平 李雪梅 杨建平 王润青 王青云 苏亮
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 水稻 蛋白磷酸酶6 过表达载体构建 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2013,（5）
• 页码范围: 59-65
• 页数: 7页
• 分类号: Q78
• 字数: 4200字
• 语种: 中文

摘要

为克隆水稻蛋白磷酸酶6（PP6）催化亚基基因OsPP6C，并构建该基因的过表达载体以及进行生物信息学分析。采用RT-PCR技术从水稻中花11叶片cDNA中扩增OsPP6C基因全长，并构建与GUS融合的pBI121-OsPP6C-GUS表达载体。通过生物信息学方法分析了OsPP6C蛋白的理化性质、与拟南芥AtPP6C（即AtFyPP）之间的同源性以及不同物种间的系统发育关系，此外，对OsPP6C基因的启动子进行了顺式作用元件分析。结果表明，该基因转录序列包含一个912 bp的开放阅读框，编码303个氨基酸残基，蛋白的分子量约为3．47 kDa，等电点为5．13；具有疏水性，但不存在信号肽，属于非分泌型蛋白。 OsPP6C与拟南芥AtFyPP1和AtFyPP3氨基酸序列一致性分别为93．73％和93．40％，系统进化树显示OsPP6C与小麦TaPP6C的亲缘关系最近，而与其他物种亲缘关系相对较远。对该基因启动子中含有的顺式作用元件分析表明，该启动子中除TATA盒和CAAT盒外，还含有多种参与光应答、激素（ ABA、乙烯、生长素、MeJA和赤霉素等）应答以及低温、热激和干旱等非生物胁迫因子应答的调控元件。为进一步研究水稻Os-PP6C基因的表达特性和功能奠定了基础。