葡萄NAC转录因子家族全基因组分析

• 作者: 李成慧 蔡斌
• 来源期刊: 上海农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 葡萄 基因家族 NAC 系谱分析 进化 生物信息学
• 年，卷（期）: 2013,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 7-13
• 页数: 7页
• 分类号: S663.1
• 字数: 3484字
• 语种: 中文

摘要

利用葡萄全基因组数据,以生物信息学的方法,在葡萄全基因组水平上对葡萄NAC基因家族进行了系谱进化关系、保守模体、共线性关系及表达情况等分析.结果表明:葡萄基因组中共存在71个葡萄NAC基因,命名为VvNAC01～VvNAC71.71个NAC基因以非随机的方式分布在19条染色体上.系谱分析表明:这些NAC基因归属于10个亚家族,分别以Ⅰ～X标记.同一亚家族中成员具有相似的模体组成.共线性分析表明,亚家族V (TIP)的3个成员可能来源于形成葡萄物种的古代六倍化事件,而第16号染色体上的TIP发生了串联复制,形成了TIP的簇群.分析公共数据库中葡萄的基因芯片数据后表明,亚家族Ⅷ和Ⅸ对非生物胁迫有响应.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	蔡斌	南京农业大学园艺学院	9	66	6.0	8.0
2	李成慧		26	71	4.0	7.0