基于建模的功能非编码RNA保守结构查询

• 作者: 周嘉 罗海琼 蓝朝旺 陈庆锋
• 来源期刊: 广西大学学报（自然科学版）
• 学科: 工学
• 关键词: 距离 模型 非编码RNA 二级结构
• 年，卷（期）: 2013,（6）
• 所属期刊栏目: 计算机与电子信息科学
• 页码范围: 1431-1435
• 页数: 5页
• 分类号: TP399
• 字数: 3466字
• 语种: 中文

摘要

许多研究已经证明了多种ncRNA的存在,并且有些非编码RNA可能在遗传系统中起着多种催化和调控作用.为了识别的ncRNA的结构一功能关系,运用一组距离约束的新方法对要预测的RNA二级结构进行建模.此外,还采用了一种过滤模式用以识别查询的二级结构的匹配模型.研究结果表明:基于距离约束的方法可以降低预测RNA二级结构的时间复杂度;而过滤模式可以过滤掉很多数据库中不相似的RNA模型.实验结果证明基于距离约束的方法在预测ncRNA结构中更具有应用价值.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	罗海琼	广西医科大学公共卫生学院	11	21	3.0	4.0
2	周嘉		47	214	6.0	13.0
3	陈庆锋	广西大学计算机与电子信息学学院	8	2	1.0	1.0
4	蓝朝旺	广西大学计算机与电子信息学学院	2	0	0.0	0.0