KPC-12型碳青霉烯酶分子进化及与β-内酰胺类药物分子对接分析

• 作者: 吴康乐 姜如金 孔海深 朱健铭 肖丹宇
• 来源期刊: 中华临床感染病杂志
• 关键词: β-内酰胺类 碳青霉烯酶 KPC-12 进化,分子 分子对接 结合自由能
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 31-34
• 页数: 4页
• 字数: 2504字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1674-2397.2013.01.007

摘要

目的 分析KPC-12型碳青霉烯酶分子进化及其与10种β-内酰胺类药物的结合自由能.方法 根据有无碳青霉烯酶活性将A类β-内酰胺酶分为两蔟,用MEGA4.1软件中的Minimum Evolution法分析KPC-2～ KPC-13、SFC-1、SME-1、IMI-1和NMC-A型具有碳青霉烯酶活性的A类β-内酰胺酶及TEM-1和SHV-1型无碳青霉烯酶活性的A类β-内酰胺酶氨基酸序列的分子进化.根据KPC-2型晶体结构在SWISS-MODEL数据库作KPC-12型同源建模,并用ArgusLab 4.1软件中的DOCK模块做KPC-12型碳青霉烯酶与10种β-内酰胺类药物底物的分子对接,最后计算酶与底物的结合自由能(△G).结果 KPC-12型与KPC-2型分子进化最为接近.KPC-12型碳青霉烯酶与β-内酰胺类药物结合自由能下降居前3位的为青霉素G钠盐、厄他培南和氨苄西林,△G分别为-8.45149、-8.36383和-8.19326 kcal/mol；结合自由能下降排在后2位的为氨曲南和克拉维酸,△G分别为-6.50614和-6.88533 kcal/mol.结论 KPC-12型碳青霉烯酶对青霉素G钠盐、厄他培南和氨苄西林的催化能力高,而对氨曲南和克拉维酸的催化能力低.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	朱健铭	杭州市余杭区中医院检验科	75	570	14.0	18.0
2	姜如金	杭州市余杭区中医院检验科	63	537	13.0	19.0
3	吴康乐	杭州市余杭区中医院检验科	55	436	12.0	17.0
4	孔海深	浙江大学医学院附属第一医院检验科	64	439	12.0	17.0
5	肖丹宇	杭州市余杭区中医院检验科	5	32	3.0	5.0