非特指型外周T细胞淋巴瘤microRNA表达谱分析及其靶基因预测

• 作者: 刘宏侠 吕宁 张建中 李敏 陈定宝
• 来源期刊: 中华病理学杂志
• 关键词: 微RNAs 淋巴瘤,T细胞,外周 计算生物学
• 年，卷（期）: 2013,（8）
• 所属期刊栏目: 人体病理学
• 页码范围: 519-524
• 页数: 6页
• 字数: 4755字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0529-5807.2013.08.004

摘要

目的 通过分析非特指型外周T细胞淋巴瘤(PTCL-NOS)肿瘤组织中microRNA(miRNA)的表达情况,探索其分子改变特征.方法 收集21例PTCL-NOS,发生于淋巴结内15例,淋巴结外6例；炎性反应增生性淋巴结组织13例；其中6例PTCL-NOS和3例炎性反应增生性淋巴结的石蜡包埋组织,应用TaqMan低密度芯片分析754种miRNA的表达差异；采用Targetscan与miRanda软件对显著差异的miRNA进行靶基因预测分析,应用生物信息学方法对靶基因进行显著的基因本体(GO)和信号通路分析.应用即时定量聚合酶链反应(qRT-PCR)进一步验证3种miRNA(miR-511、miR-1291、miR-572)在15例PTCL-NOS与10例炎性反应增生性淋巴结中的表达情况.结果 芯片检测发现7种miRNA(miR-886-3p、miR-511、miR-1291、miR-572、miR-27a-3p、miR-25-3p、miR-886-5p)在PTCL-NOS中表达上调,而miR-182-5p表达下调(P＜0.05).预测靶基因显著性GO有63个、信号通路61条.3种miRNA的qRT-PCR结果与芯片分析miRNA表达趋势相同,其中miR-572和miR-1291在PTCL-NOS中表达上调,差异具有统计学意义(P＜0.05).结论 这8种miRNA在PTCL-NOS中表达异常,可能参与该肿瘤发生发展的分子调控；其中涉及多种靶基因与复杂的信号通路.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈定宝	北京大学人民医院病理科	75	285	8.0	11.0
2	李敏	安徽医科大学解放军第三○六医院临床学院病理科	79	430	11.0	15.0
3	吕宁	中国医学科学院肿瘤医院病理科	38	227	8.0	14.0
4	刘宏侠	河北省唐山市协和医院病理科	13	36	3.0	5.0
5	张建中	安徽医科大学解放军第三○六医院临床学院病理科	3	11	2.0	3.0