低温对罗非鱼基因组DNA甲基化的影响

• 作者: 刘志刚 刘玉姣 卢迈新 可小丽 朱华平 李庆勇 高风英 黄樟翰
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 尼罗罗非鱼 低温 DNA甲基化 甲基化敏感扩增多态性
• 年，卷（期）: 2013,（10）
• 页码范围: 1460-1467
• 分类号: Q784|S917.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1231.2013.38611

摘要

以经过连续多代抗寒选育获得的尼罗罗非鱼耐寒品系为实验材料,采用DNA甲基化敏感扩增多态性(methylation sensitive amplified polymorphism,MSAP)分析方法从全基因组水平上探讨了低温适应对罗非鱼DNA序列中CCGG位点的甲基化水平的影响.结果显示,选用的18对选择性扩增引物共检测到849个位点.耐寒品系检测到的位点数为411个,对照组为438个,其中发生甲基化的位点数分别为72和104个,总甲基化率分别为17.52％和23.74％；全甲基化位点分别为37个和65个,全甲基化率分别为9.00％和14.84％；半甲基化位点分别为35个和39个,半甲基化率分别为8.52％和8.90％.结果分析表明,尼罗罗非鱼耐寒品系的总甲基化水平、全甲基化水平和半甲基化水平较对照组均有一定程度的下降.与对照组相比,尼罗罗非鱼耐寒品系基因组DNA甲基化总体水平下降了6.22％,其中以全甲基化位点变异为主,其下降幅度比例明显,为5.84％.由此可见,经过连续多代的低温胁迫可导致尼罗罗非鱼DNA甲基化水平发生改变,发生了去甲基化反应,表现为基因组甲基化程度降低的特征,说明了DNA甲基化与罗非鱼抗寒性反应密切相关.