脊尾白虾血细胞全长 cDNA 文库的构建及 EST 序列分析

• 作者: 刘萍 李健 李吉涛 段亚飞 陈萍
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 脊尾白虾 血细胞 cDNA 文库 EST 序列分析
• 年，卷（期）: 2013,（2）
• 页码范围: 243-249
• 分类号: Q959
• 字数: 4485字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1118.2013.00243

摘要

采用 SMART 技术(Switching Mechanism At 5′ end of RNA Transcript)构建了脊尾白虾(Exopalaemon carini-cauda)血细胞全长 cDNA 文库.结果表明:cDNA 初级文库滴度为2.8×106 pfu/mL,重组率达99%以上,插入片段在400~2000 bp;扩增文库滴度为4.3×109 pfu/mL.随机挑取100个单克隆进行测序,得到95条平均长度为493 bp的高质量 EST 序列,序列拼接获得70条 unigenes,包括11条 contigs 和59条 singlets.Blast 同源比对发现,其中20条 unigenes 与数据库中已知基因同源性较高,2条为未知基因,48条未知序列.通过同源性比较筛选出多个与生长、代谢、免疫等相关的功能基因,如肌钙蛋白Ⅰ、烯醇酶、抗脂多糖因子、溶菌酶等基因.结果证实,所构建的脊尾白虾血细胞全长 cDNA 文库质量较高,可在短期内获得大量脊尾白虾血细胞组织的功能基因表达信息.本研究旨在为脊尾白虾功能基因的发掘和分子标记的筛选提供素材.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘萍	中国水产科学研究院黄海水产研究所	124	3043	33.0	48.0
2	李健	中国水产科学研究院黄海水产研究所	215	3950	34.0	49.0
3	李吉涛	中国水产科学研究院黄海水产研究所	34	329	11.0	15.0
4	陈萍	中国水产科学研究院黄海水产研究所	29	373	13.0	17.0
5	段亚飞	上海海洋大学水产与生命学院	3	31	3.0	3.0