大珠母贝（Pinctada maxima）α-淀粉酶基因cDNA及内含子克隆分析

• 作者: 喻达辉 成书营 潘俐玲 王晓宁 黄桂菊
• 来源期刊: 热带海洋学报
• 关键词: 大珠母贝 α-淀粉酶基因 外显子 内含子 序列特征
• 年，卷（期）: 2013,（3）
• 所属期刊栏目: 海洋生物学
• 页码范围: 52-58
• 页数: 7页
• 分类号: P735.54
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-5470.2013.03.008

摘要

α-淀粉酶广泛分布于动物、植物和微生物中，是贝类软体动物的主要消化酶，对贝类生长有重要影响。文章首次获得大珠母贝α-淀粉酶基因(命名为pmAMY, Pictada maxima alpha amylase)，其cDNA全长1732bp，其中5'UTR 25bp，ORF 1554bp，编码518个氨基酸，3'UTR 153bp，分子量为57.7KDa，等电点7.63。氨基酸序列分析表明，pmAMY 的氨基酸序列包括16个氨基酸组成的信号肽序列(MLLIVCSIAFFHSVYG)、8个半胱氨酸位点(Cys46、Cys104、Cys157、Cys176、Cys392、Cys398、Cys464、Cys476)、3个活性催化位点(Asp213、Glu249、Asp314)、4个钙结合位点(Asn118、Arg174、Asp183、His217)、3个氯离子结合位点(Arg211、Asn312、Arg350)和4段保守序列(Ile111-Val116、Val207-Ala215、Phe247-Val251、Val308-Asn315)。pmAMY的氨基酸序列与企鹅珍珠贝(Pteria penguin)同一性最高，为82%；与超嗜热古菌(Thermococcus hydrothermalis)同一性最低仅为27%；与其他物种的同一性在57%-79%之间。克隆获得大珠母贝pmAMY基因的2个内含子，长度分别为846bp、162bp。2个内含子都起始于GT，终止于AG，符合内含子共同剪接位点序列。组织表达分析表明pmAMY只在肝胰脏中表达。本研究为α-淀粉酶基因的功能分析、单核苷酸多态性(SNP, single nucleotide polymorphism)位点分离及其与生长性状的关联分析奠定了基础。