4株新城疫病毒F蛋白和HN蛋白的计算机模建与表面抗原分析

• 作者: 任涛 席瑞珍 廖明 胡思科
• 来源期刊: 华南农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: F蛋白 HN蛋白 模建 表面蛋白溶剂可及表面积(ASA)
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 所属期刊栏目: 动物科学与兽医学
• 页码范围: 87-92
• 页数: 6页
• 分类号: S852.65
• 字数: 3321字
• 语种: 中文

摘要

选取新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)广东分离毒GM株(强毒株)和JM株(弱毒株)以及疫苗毒La-Sota株和标准强毒F48E9株,对其融合蛋白(F)和神经氨酸酶(HN)的编码基因序列进行分析,并利用Insight Ⅱ软件包(Version 2000)进行F蛋白和HN蛋白C端蛋白单体的空间结构模建.结果显示,4个NDV毒株F蛋白单体分子的空间结构极为相似,大致分为3部分,即头部、茎部和柄部.其中头部结构主要由一些折叠股组成,茎部和柄部主要由螺旋结构组成.比较各毒株F蛋白表面蛋白溶剂可及表面积(ASA)后发现,该蛋白有5个线性B细胞表位和8个比较保守的抗原决定簇位点,蛋白头部残基的空间位置随毒株的不同而变异较大.GM株与F48E9株存在36个氨基酸残基的差异,JM株和LaSota株存在20个氨基酸残基的差异.研究结果还表明,4个NDV毒株的HN蛋白C端空间结构较保守,由多个折叠股和4段螺旋结构组成,其抗原决定簇位点也高度保守,只有4个氨基酸残基存在差异.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	廖明	华南农业大学兽医学院	182	1407	18.0	31.0
2	胡思科	华南农业大学兽医学院	6	42	4.0	6.0
4	任涛	华南农业大学兽医学院	84	330	10.0	16.0
7	席瑞珍	华南农业大学兽医学院	2	5	1.0	2.0