多位点串联重复序列分析方法在嗜麦芽窄食单胞菌分子分型中的应用

• 作者: 卢金星 李文革 田国忠
• 来源期刊: 疾病监测
• 学科: 医学
• 关键词: 嗜麦芽窄食单胞菌 分子分型 多位点串联重复序列
• 年，卷（期）: 2013,（9）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 753-756
• 分类号: R181.3+4
• 语种: 中文

摘要

目的 探讨多位点串联重复序列分析方法(multiple-locus variable-number tandem repeat analysis,MLVA)在嗜麦芽窄食单胞菌分型中的应用.方法 选用文献报道的12个嗜麦芽窄食单胞菌串联重复序列位点及引物,采用聚合酶链反应(PCR)和琼脂糖凝胶电泳,根据凝胶电泳图谱计算出各位点的串联重复单元拷贝数,通过BioNumerics(Version 4.0,Applied Maths BVBA,Belium)聚类分析.结果 设置12个位点串联重复单元拷贝数100％的相似性为判断标准,可将106株嗜麦芽窄食单胞菌分为34个MLVA基因型,流行病学上有关联的菌株具有相同的基因型.设置12个位点串联重复单元拷贝数45％相似性为判断标准,将106株菌株分为11个群,相同的地域、分离来源和分离部位的菌株具有相关性.结论 串联重复序列位点分型技术具有简便、快速、特异、可比性、可重复性和高鉴别力等优点,适合嗜麦芽窄食单胞菌的分子流行病学研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李文革	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所	13	73	5.0	8.0
2	卢金星	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所	25	140	7.0	10.0
3	田国忠	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所	25	57	4.0	6.0