玉米LIM结构域蛋白基因家族分析

• 作者: 张海燕 李佐同 杨克军 王玉凤 胡雪微 赵莹 赵长江
• 来源期刊: 玉米科学
• 学科: 农学
• 关键词: 玉米 LIM结构域 LIM基因家族 生物信息学
• 年，卷（期）: 2013,（3）
• 页码范围: 40-47
• 页数: 8页
• 分类号: S513.035.3
• 字数: 6126字
• 语种: 中文

摘要

采用生物信息学的方法，在玉米全基因组水平鉴定并分析玉米LIM蛋白基因，鉴定出11个ZmLIM基因，分别分布于玉米的8条染色体上。结构域分析表明，多数LIM蛋白包括2个典型的LIM结构域。系统发育分析表明，LIM家族可以分为3个亚家族。假定调控元件分析发现，所有LIM基因启动子都具有大量花粉特异表达元件，相对来说其他组织器官特异表达，激素和逆境调控元件数量很少。EST基因表达数据分析表明，该家族成员具有明显的时空表达特性。