水稻条纹病毒安徽分离物NS3基因的克隆及其RNA沉默抑制子功能的初步鉴定

• 作者: 丁菲 宋培培 江彤 贾琳 邓竹根
• 来源期刊: 安徽农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 水稻条纹病毒 NS3基因 克隆 序列分析 RNA沉默抑制子
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 植物保护
• 页码范围: 636-641
• 分类号: S435.111.42
• 语种: 中文

摘要

采集安徽马鞍山水稻条纹叶枯病感病稻株,TRIzol法提取样本总RNA,设计特异性引物进行RT-PCR扩增,获得水稻条纹病毒(RSV)安徽分离物的RNA3部分片段,克隆并测序.序列分析表明,该片段全长874 nts,含有完整的NS3基因,NS3基因序列长度为636 nts,编码211个氨基酸.序列比对发现,RSV安徽分离物NS3基因与来源于华东各省市RSV分离物NS3基因间的序列相似性高达97.6％ ～ 99.4％,而与RSV云南分离物NS3基因间的序列相似性相对较低,为93.4％ ～ 95.4％.构建RSV NS3基因系统关系树,发现RSV安徽分离物NS3基因与来源于华东各省市8个RSV分离物NS3基因聚成一个单独的分支,说明华东各省市各个RSV分离物亲缘关系最近.将RSV安徽分离物NS3基因插入植物表达载体pBIN438,构建重组植物表达载体pBIN-NS3并转化农杆菌.将含pBIN-NS3的农杆菌和含pBIN-GFP的农杆菌共浸润16c本氏烟叶片,6天后紫外灯下观察发现,共浸润区表现出强烈的绿色荧光,说明16c本氏烟GFP基因局部沉默被抑制,可以初步证明RSV安徽分离物编码的NS3蛋白是一个RNA沉默抑制子.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	江彤	安徽农业大学植物保护学院	62	201	6.0	10.0
2	邓竹根	安徽农业大学植物保护学院	3	8	2.0	2.0
3	丁菲		3	8	2.0	2.0
4	贾琳		2	4	1.0	2.0