苏钟猪FTO基因的mRNA表达、克隆测序及其生物信息学分析

• 作者: 付言峰 任守文 方晓敏 李兰 李碧侠 王学敏 赵芳
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 苏钟猪 脂肪肥胖相关基因 克隆测序 遗传变异 生物信息学
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 页码范围: 128-134
• 页数: 7页
• 分类号: Q78
• 字数: 5024字
• 语种: 中文

摘要

脂肪肥胖相关基因(FTO)在控制食欲和能量消耗方面具有重要作用.为进一步了解猪FTO基因的结构和功能,以苏钟猪为试验对象,利用RT-PCR方法,分析该基因在苏钟猪5种不同组织(肺脏、肝脏、心脏、背膘和背最长肌)RNA水平的表达谱信息；对苏钟猪FTO基因的编码序列(CDS)进行了克隆测序,并用生物信息学方法分析了苏钟猪FTO蛋白的结构和不同物种间的同源性.结果表明,FTO基因在苏钟猪各组织中的mRNA表达丰度表现为:背膘＞心脏＞肺脏＞肝脏＞背最长肌,其中背膘中的表达量显著高于其他组织(P＜0.05).苏钟猪FTO的CDS区发现了8个SNPs,分别为G52A、C523T、G628A、A655G、A810G、A886G、G1002A和A1344G.苏钟猪FTO基因编码一个含505个氨基酸的蛋白,理论等电点为5.23,具有亲水性,不存在信号肽,是非分泌型蛋白,与牛、绵羊、狗等物种的亲缘关系最近.FTO的mRNA表达对苏钟猪的皮下脂肪、心脏、肌肉等组织的脂肪沉积有一定影响,其编码序列中丰富的SNPs可成为苏钟猪肉质改良育种中的重要分子标记.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李兰	中国农业大学动物医学院	26	167	9.0	10.0
3	赵芳	江苏省农业科学院畜牧研究所	9	50	4.0	6.0
4	李碧侠	江苏省农业科学院畜牧研究所	43	126	7.0	8.0
5	任守文	江苏省农业科学院畜牧研究所	58	191	7.0	10.0
6	王学敏	江苏省农业科学院畜牧研究所	38	117	7.0	8.0
7	方晓敏	江苏省农业科学院畜牧研究所	32	110	7.0	9.0
8	付言峰	江苏省农业科学院畜牧研究所	18	64	5.0	7.0