长牡蛎糖原磷酸化酶基因SNPs与生长性状和糖原含量的相关性分析

• 作者: 于红 刘思玮 孔令锋 李琪
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 长牡蛎 糖原磷酸化酶基因 生长性状 糖原 SNPs
• 年，卷（期）: 2013,（3）
• 页码范围: 481-489
• 分类号: S959
• 字数: 5015字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1118.2013.00481

摘要

为研究糖原磷酸化酶基因多态性与长牡蛎(Crassostrea gigas)生长和糖原含量的相关性,本研究对长牡蛎糖原磷酸化酶基因(Cg-GPH)编码区单核苷酸多态性(SNPs)与来自5个家系322个长牡蛎个体的生长性状(包括壳高、壳长、壳宽、总体质量以及软体部质量)和糖原含量进行了关联分析.结果表明,在1940 bp的长牡蛎糖原磷酸化酶基因中共检测到82个SNPs位点,其中63个SNPs位点位于外显子区域,1个SNPs位点位于5′-UTR区,18个SNPs位点位于3′-UTR区,编码区SNPs平均密度为1/25 bp;5个SNPs位点与生长性状存在显著相关(P<0.05),未检测到与糖原含量相关SNPs.根据以上5个SNPs位点共构建得到6个SNP单倍型,其中,Cg-GPH基因的H6(CTGAT)单倍型在总体质量性状方面均显著高于其他5种单倍型(P<0.05),表明H6单倍型可能是对长牡蛎体质量增加最有利的单倍型.研究结果为今后长牡蛎生长性状的遗传改良提供了基础资料.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李琪	中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室	152	1522	20.0	31.0
2	孔令锋	中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室	79	808	16.0	24.0
3	于红	中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室	49	498	12.0	20.0
4	刘思玮	中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室	1	17	1.0	1.0