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摘要:
使用TAKARA的SMARTer TMRACE cDNA Amplification Kit和改进的Quantscript RT kit方法制备了3组源于同一中华大蟾蜍(Bufo gargarizans)个体皮肤总核糖核酸(RNA)的第一链互补脱氧核糖核酸(cDNA),并以此为模板通过聚合酶链式反应(PCR,polymerase chain reaction)扩增半乳糖凝聚素3(gal-3)的全长开放阅读框(ORF,open reading frame),然后进行PCR产物的克隆、测序,再通过多种形式的序列比对分析该基因多样性产生的原因.从3组实验得到31个克隆,去除组内和组间重复出现的序列,共获得16个不同的cDNA.相同的序列,相同的单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphism,SNP)以及相同位置相同数目的碱基缺失在3组独立的实验中重复出现,表明gal-3基因多样性.实际上,gal-3基因的多样性导致其编码蛋白的多样性.尽管如此,推导的氨基酸序列比对显示半乳糖凝聚素3糖基结合位点、磷酸化位点以及与其生物学功能关系密切的相关基序均高度保守,暗示中华大蟾蜍皮肤gal-3基因多样性的客观存在.
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文献信息
篇名 中华大蟾蜍gal-3基因多样性的原因分析
来源期刊 华东师范大学学报(自然科学版) 学科 生物学
关键词 中华大蟾蜍 半乳糖凝聚素3 分子多样性
年,卷(期) 2013,(6) 所属期刊栏目 生命科学
研究方向 页码范围 171-180
页数 10页 分类号 Q38
字数 5817字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1000-5641.2013.06.021
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 杨仙玉 浙江农林大学林业与生物技术学院 18 52 4.0 6.0
2 张姝芳 浙江农林大学林业与生物技术学院 7 19 3.0 4.0
3 诸葛慧 浙江农林大学林业与生物技术学院 6 18 3.0 4.0
4 万文彬 浙江农林大学林业与生物技术学院 3 5 2.0 2.0
5 潘李念 浙江农林大学林业与生物技术学院 2 4 2.0 2.0
6 周品品 浙江农林大学林业与生物技术学院 2 4 2.0 2.0
传播情况
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半乳糖凝聚素3
分子多样性
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相关学者/机构
期刊影响力
华东师范大学学报(自然科学版)
双月刊
1000-5641
31-1298/N
16开
上海市中山北路3663号
4-359
1955
chi
出版文献量(篇)
2430
总下载数(次)
5
总被引数(次)
17499
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
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