牡丹Ty3-gypsy类反转录转座子反转录酶序列的克隆及分析

• 作者: 侯小改 张曦 郭大龙 黄燕梅
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 牡丹 Ty3-gypsy类反转录转座子 反转录酶 异质性
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 所属期刊栏目: 观赏植物
• 页码范围: 98-106
• 分类号: S685.11
• 语种: 中文

摘要

根据Ty3-gypsy反转录转座子反转录酶的保守序列设计简并引物,从中原牡丹(Paeonia suffruticosa Andrews)品种‘洛阳红’和野生种卵叶牡丹(Paeonia qiui Y.L.Pei et D.Y Hong)中扩增出430 bp左右的目标片段.目的条带经回收、克隆、测序及相关生物信息学软件进行序列分析后,获得了13条来自牡丹的Ty3-gypsy反转录转座子反转录酶序列.这些核苷酸序列具有较高的异质性,主要表现为缺失突变,序列长度变化范围为412 ～446 bp,同源性范围为71.5％ ～ 94.8％.翻译成氨基酸后,有12条序列出现1～9个不同程度的终止密码子突变,3条序列出现移框突变.其核苷酸序列经过系统聚类后可分为6个家族.将其氨基酸序列与已登录的不同物种Ty3-gypsy反转录转座子反转录酶的氨基酸序列进行聚类分析,结果表明与其他植物具有较高的同源性,表明它们间可能存在着Ty3-gypsy反转录转座子的横向传递.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	侯小改	河南科技大学农学院	99	893	17.0	26.0
2	郭大龙	河南科技大学林学院	50	461	12.0	19.0
3	张曦	河南科技大学农学院	4	41	4.0	4.0
4	黄燕梅	河南科技大学林学院	1	10	1.0	1.0