中华虎头蟹线粒体16S rRNA和CO Ⅰ基因的序列比较及其系统进化分析

• 作者: 刘萍 李健 李吉涛 段亚飞 毛智超 高保全
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 中华虎头蟹 线粒体DNA 16S rRNA基因 COⅠ基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2013,（10）
• 页码范围: 1441-1451
• 分类号: Q785|S917.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1231.2013.38763

摘要

为研究中华虎头蟹野生群体的种质资源及遗传多样性状况,采用PCR扩增获得中华虎头蟹线粒体DNA的16S rRNA和CO Ⅰ基因片段,分别对其进行序列比较及系统进化分析.16S rRNA和CO Ⅰ基因片段的A+T平均含量分别为67.7％和61.4％,A+T含量显著高于G+C含量.长度为515 bp的16S rRNA基因片段共检测出单倍型4种,多态性位点4个,均为单一变异位点；长度为653 bp的CO Ⅰ基因片段共检测出单倍型1 1种,多态性位点23个,其中简约信息位点5个和单一变异位点18个.CO Ⅰ基因片段比16S rRNA基因片段具有较大的变异,更适于中华虎头蟹种群的遗传多样性分析.基于16S rRNA和CO Ⅰ基因片段的遗传距离与系统进化分析结果一致,表明中华虎头蟹与梭子蟹科的蟹类亲缘关系最近,方蟹科与沙蟹科的蟹类聚为一支,与传统分类结果基本一致；而脊椎动物2个基因片段的系统进化分析结果不一致.根据16S rRNA基因片段的遗传距离推测出4科7种蟹的大致分化时间发生在古新世至始新世.