不同单株叶籽银杏DNA甲基化水平与模式的MSAP分析

• 作者: 张倩 李际红 王东升 王聪聪 邢世岩
• 来源期刊: 核农学报
• 关键词: 叶籽银杏 DNA甲基化 MSAP分析 表观遗传学
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 植物诱变育种·农业生物技术
• 页码范围: 399-407
• 语种: 中文

摘要

以叶籽银杏和普通银杏叶片为试材,利用EcoR Ⅰ和HpaⅡ/MspⅠ双酶切建立适合于叶籽银杏全基因组的甲基化敏感扩增多态性(MSAP)分析体系,在全基因组水平对11株叶籽银杏和1株正常银杏的胞嘧啶甲基化水平和模式进行评估.结果表明,从36对MSAP选扩引物中,选出14对MSAP引物组合,共扩增产生2766条清晰可辨且可重复的DNA条带,产生3种类型的甲基化条带.在全部扩增位点中,检测到叶籽银杏基因组CCGG序列的甲基化比率为26.42％ ～ 65.79％,正常银杏总甲基化率达30.79％,不同单株的叶籽银杏平均总甲基化率达38.61％,叶籽银杏甲基化事件的发生频率为11.27％～27.34％.方差分析显示不同单株间DNA甲基化水平差异极显著.主成分分析绘制的主分量散点图与聚类分析结果一致,不同单株的叶籽银杏可分为3大类.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邢世岩	山东农业大学林学院农业生态与环境重点实验室	151	1426	20.0	27.0
2	李际红	山东农业大学林学院农业生态与环境重点实验室	53	559	12.0	21.0
3	张倩	山东农业大学林学院农业生态与环境重点实验室	30	101	5.0	8.0
4	王聪聪	山东农业大学林学院农业生态与环境重点实验室	5	48	3.0	5.0
5	王东升	山东农业大学林学院农业生态与环境重点实验室	7	50	6.0	7.0