中国沿海9种红藻 hsp70基因序列及系统进化分析

• 作者: 孙雪 徐丽宁 杨锐 王亚军 王淑刚 陈娟娟
• 来源期刊: 海洋学报（中文版）
• 学科: 农学
• 关键词: 红藻 hsp70 系统进化
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 页码范围: 188-200
• 页数: 13页
• 分类号: Q949.29|S336
• 字数: 6837字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0253-4193.2013.04.022

摘要

本研究自山东青岛、浙江象山和江苏南通采集共9种红藻样品，隶属于2纲、5目、6科、8属（据NCBI），克隆各红藻 hsp70基因，并对所获序列进行分析。利用特异性引物P1/P3扩增，得到的目的条带约630 bp ，分析所推导的氨基酸序列发现：所获得片段均位于 HSP70的ATPase 结构域附近。9种红藻 hsp70序列之间的遗传距离在0.078～0.319之间，序列相似度在73％～92％之间，其保守性略低于HSP70蛋白；基因对A或T结尾的密码子表现出很高的偏好性，CGC与TGG这两种密码子在这9种红藻HSP70氨基酸密码子中未出现。上述表明 hsp70及HSP70密码子偏好性可应用于红藻分子系统学研究。基于多物种 HSP70构建的进化树可见，Cyanidium caldarium与Cyanidioschy-zon merolae strain 10D两种原始红藻的起源早于其他红藻，紫菜次之，本研究中9种红藻系统发生符合NCBI的描述。在真菌、藻类和植物中，营养方式的差异可能是造成HSP70进化树分化的基本原因，而相同形态类型的物种中，环境适应是抗逆能力强、遗传结构稳定的物种生物分子进化的重要因素。