基于线粒体Cytb基因全序列的松江鲈群体遗传结构分析

• 作者: 李创举 毕潇潇 赵林林 高天翔
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 松江鲈 Cytb基因 全序列 遗传结构 群体扩张
• 年，卷（期）: 2013,（2）
• 页码范围: 199-207
• 页数: 9页
• 分类号: Q347
• 字数: 5681字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7541/2013.5

摘要

对松江鲈(Trachidermus fasciatus Heckel)中国沿海7个群体和日本有明海群体的线粒体Cytb基因全序列进行了测定、分析.结果显示:47个个体共检测到31个单倍型,8个群体均呈现出较高的单倍型多样性(0.60-1.00)和较低的核苷酸多样性(0.0005-0.0041)的特点.AMOVA分析结果及单倍型邻接关系树和单倍型网络关系图均显示松江鲈分为中国和日本两个世系,而中国世系的7个群体未呈现出明显的地理遗传结构.基于核苷酸Kimura双参数替代模型计算得出的中国和日本两个世系的净遗传距离,再参照其他硬骨鱼类线粒体Cytb基因2%/Ma(百万年)的分歧速率,推测松江鲈中日两个世系间分化时间约为41万年前.对中国世系进行群体历史动态分析,中性检验结果均为负值且显著,核苷酸不配对分布呈单峰型,表明松江鲈中国世系曾发生过群体扩张,其扩张时间大约为12万年前.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	高天翔	中国海洋大学海洋生物多样性与进化研究所	154	2739	28.0	41.0
2	李创举	中国水产科学院长江水产研究所	10	71	3.0	8.0
3	毕潇潇	中国海洋大学海洋生物多样性与进化研究所	3	112	3.0	3.0
4	赵林林	中国海洋大学海洋生物多样性与进化研究所	3	53	2.0	3.0