稀有(鮈)鲫卵黄蛋白原基因全序列的克隆与分析

• 作者: 刘红 蔡生力 黄婷妹
• 来源期刊: 上海海洋大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 卵黄蛋白原 稀有(鮈)鲫 基因组步移 序列分析
• 年，卷（期）: 2013,（5）
• 所属期刊栏目: 水产生物技术
• 页码范围: 678-683
• 分类号: S917
• 语种: 中文

摘要

稀有(鮈)鲫(Gobiocypris rarus)是我国特有的一种小型鲤科鱼类,目前已作为一种新型模式生物应用于实验研究.运用普通PCR方法克隆得到一段长6 299 bp的序列,序列分析发现编码区与稀有(鮈)鲫卵黄蛋白原cDNA序列相似性为100％.再参考6 299 bp序列5'端设计两对特异性引物,进行基因组步移,获得长度为1 285 bp的序列.经过序列拼接后得到7 573 bp的序列,分析发现其中含卵黄蛋白原基因全序列长度为6 595 bp卵黄蛋白原基因上游调控序列长度为978 bp.进一步分析开放性阅读框得知:稀有(鮈)鲫卵黄蛋白原基因含有26个外显子和25个内含子,编码1 299个氨基酸序列,CDS长3 900 bp.经BLAST比对发现,稀有(鮈)鲫卵黄蛋白原上游调控序列中220 ～838 bp区间与朝鲜(鱼)(Acheilognathus yamatsutae)卵黄蛋白原基因启动子序列2 857 ～3 469 bp区间有80％相似性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	蔡生力	上海海洋大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室	41	178	7.0	10.0
2	刘红	上海海洋大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室	33	142	7.0	9.0
3	黄婷妹	上海海洋大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室	1	0	0.0	0.0