基于快速傅里叶变换的蛋白质-蛋白质对接程序的研究进展

• 作者: 方慧生 黄南曦
• 来源期刊: 药物生物技术
• 学科: 生物学
• 关键词: 蛋白质-蛋白质对接 对接程序 刚性搜寻 搜寻算法 快速傅里叶变换 打分函数
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 所属期刊栏目: 综述
• 页码范围: 76-80
• 页数: 5页
• 分类号: Q811.4
• 语种: 中文

摘要

蛋白质-蛋白质相互作用与识别的研究是分子生物学领域的重要课题.然而由于蛋白质分子巨大,即使将蛋白质看成刚体,在没有指导信息的情况下,系统地搜寻和评估上亿个可能的对接取向十分困难,人们为了解决这个难点,发展了许多搜寻算法,快速傅里叶变换(Fast fourier transform,FFT)便是其中最为流行的算法之一.而打分函数与蛋白质对接结果的准确性密切相关,也是蛋白质-蛋白质对接的难点之一.该文概述了基于快速傅里叶变换的蛋白质-蛋白质对接程序的一般过程.同时,概述了使用与FFT算法的打分函数的一般特征,并且以形状互补、静电力、去溶剂化和统计势能3类介绍了典型的FFT算法下的打分函数.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	方慧生		28	84	6.0	8.0
2	黄南曦		1	0	0.0	0.0