云南省鼠疫耶尔森菌多位点可变数目串联重复序列分析

• 作者: 宋志忠 张蓉 朱俊洁 梁莹 海荣 王鹏
• 来源期刊: 疾病监测
• 学科: 医学
• 关键词: 鼠疫耶尔森菌 MLVA分型方法 基因型 生态分型
• 年，卷（期）: 2013,（10）
• 所属期刊栏目: 自然疫源性疾病监测
• 页码范围: 848-852
• 分类号: R516.8
• 语种: 中文
• DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2013.10.016

摘要

目的 通过多位点可变数日串联重复序列分析(multiple-locus variable-number tandem-repeat analysis,MLVA)方法,对云南省鼠疫菌株进行基因分型.方法 采用聚合酶链反应(PCR)和毛细管电泳,通过BioNumerics软件进行处理,分析云南省158株鼠疫耶尔森菌基因型.结果 选取鼠疫菌的14个VNTR位点,5个VNTR位点对云南省鼠疫菌具有多态性分析意义,利用这5个位点对云南菌株进行分析,云南158株鼠疫菌可分为2个群,3个簇,5个基囚型,野鼠鼠疫菌属于A簇,丽江玉龙鼠疫菌属于B簇,家鼠鼠疫菌属于C簇,与传统的生态分型结果吻合.结论 本次试验筛选的5个位点可以用于云南省鼠疫菌的分型,云南家鼠鼠疫菌、野鼠鼠疫菌及玉龙鼠疫菌分属不同的基因簇,玉龙鼠疫菌与野鼠鼠疫菌同属一个群,聚类结果与实际的地理相关性很好.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	宋志忠		66	250	9.0	11.0
2	海荣	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所鼠疫室	31	203	9.0	12.0
3	王鹏		42	117	6.0	8.0
4	朱俊洁		2	12	2.0	2.0
6	梁莹	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所鼠疫室	7	26	3.0	5.0
9	张蓉	大理学院公共卫生学院	2	16	2.0	2.0