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宿根矮化病菌诱导甘蔗差异表达基因的cDNA-SCoT分析
宿根矮化病菌诱导甘蔗差异表达基因的cDNA-SCoT分析
作者:
宋修鹏
张保青
李杨瑞
杨丽涛
陈保善
陈明辉
陈虎
原文服务方:
作物学报
甘蔗
宿根矮化病
cDNA-SCoT
差异基因
摘要:
宿根矮化病是危害严重的世界性甘蔗主要病害之一,为了探究甘蔗在该病胁迫下的抗病分子机制,本研究以甘蔗品种新台糖22健康植株为材料,利用含有宿根矮化病病原菌的蔗汁诱导其抗性,分别在接种后2、4、6、8和10 d取样,构建宿根矮化病侵染处理与对照的RNA混合池,利用cDNA-SCoT法进行差异显示研究.结果表明,80条SCoT引物扩增出500多条带,长度在100~1800 bp之间.从中筛选出30个差异明显的条带,测序后序列拼接,获得22条高质量的EST序列.生物信息学分析显示,对甘蔗宿根矮化病的差异基因主要涉及能量代谢、防卫反应、信号转导、蛋白质类代谢等方面.进一步基因功能分析显示,油菜素内酯合成蛋白、NBS-LRR类抗性蛋白、茉莉酸诱导蛋白、α-微管蛋白、ABA胁迫成熟蛋白、富含脯氨酸蛋白、翻译起始因子eif-2bα亚族等可能参与了甘蔗宿根矮化病病原菌互作的过程.
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甘蔗
cDNA-SCoT
差异表达
内容分析
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文献信息
篇名
宿根矮化病菌诱导甘蔗差异表达基因的cDNA-SCoT分析
来源期刊
作物学报
学科
关键词
甘蔗
宿根矮化病
cDNA-SCoT
差异基因
年,卷(期)
2013,(6)
所属期刊栏目
研究简报
研究方向
页码范围
1119-1126
页数
8页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.3724/SP.J.1006.2013.01119
五维指标
传播情况
被引次数趋势
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版权信息
全文
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引文网络
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节点文献
甘蔗
宿根矮化病
cDNA-SCoT
差异基因
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
作物学报
主办单位:
中国作物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0496-3490
CN:
11-1809/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1950-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
5614
总下载数(次)
0
总被引数(次)
197718
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