南极普利兹湾夏季海冰不同层次细菌丰度及多样性

• 作者: 俞勇 曾胤新 李会荣 杜宗军 罗玮 陈波 马吉飞
• 来源期刊: 微生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 南极 普利兹湾 细菌 16S rRNA 丰度 多样性
• 年，卷（期）: 2013,（2）
• 所属期刊栏目: 生态和环境微生物
• 页码范围: 185-196
• 分类号: Q938.1
• 语种: 中文

摘要

[目的]为了解南极普利兹湾夏季海冰不同层次中细菌群落丰度及组成.[方法]利用荧光原位杂交技术对海冰不同层次中细菌进行定量研究,通过构建16S rRNA基因文库对海冰不同层次中细菌进行多样性分析,并结合环境因子进行相关性分析.[结果]荧光原位杂交结果表明,细菌占海冰总细胞数比例随着海冰层次下降呈现上升趋势,初步推断可能受海冰中总有机碳,总有机氮以及磷酸盐影响所致.16SrRNA基因文库分析结果表明,上、中、底3个海冰分层样品获得的16S rRNA基因序列归属于γ-变形细菌纲(γ-Proteobacteria),α-变形细菌纲(α-Proteobacteria)以及拟杆菌门(Bacteroidetes),多数16S rRNA基因序列与分离培养自海洋环境、南北极海冰菌株的16S rRNA基因序列相似性较高(90％-99％)；在海冰底部样品中未检测到拟杆菌门；海冰不同层次中,细菌组成呈现些微的差异性,可能由铵离子在海冰不同层次的分布造成.[结论]海冰底部细菌数量最丰富.在海冰中,γ-变形细菌纲为优势类群.