低温会影响水稻正常的生长和发育,增强耐冷性已成为水稻育种的主要目标之一.为了鉴定和定位水稻耐冷性相关位点,本研究以广陆矮4号(受体)与日本晴(供体)杂交获得的染色体片段代换系群体中的1个低温敏感株系C32022为材料,测定低温处理后植株存活率,采用代换作图法在水稻第3染色体上定位一个控制水稻苗期耐冷性的QTL,命名为qCTS3-1.利用C32022和广陆矮4号衍生的F2分离群体进行遗传分析,结果显示,该群体中叶片表现正常绿色与叶片表现出黄色、萎蔫单株比例符合1∶3分离比,表明耐冷性受单个主效QTL控制.来自日本晴的等位基因能够增加植株对低温的敏感性.利用该群体中86个隐性单株将qCTS3-1初步定位在分子标记WZD-S3-7~WZD-S3-11,物理距离约为550 kb.