采用PCR-DGGE技术分析瘤胃菌群在不同纤维素富集条件下的多样性

• 作者: 倪学勤 孙朋 张洪瑜 曾东 曾燕 杨杰
• 来源期刊: 动物营养学报
• 学科: 农学
• 关键词: 瘤胃菌群 纤维素 PCR-DGGE 聚类分析 主成分分析
• 年，卷（期）: 2013,（9）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 2136-2142
• 页数: 7页
• 分类号: S852.6
• 字数: 4145字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-267x.2013.09.028

摘要

本试验旨在采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术分析瘤胃菌群在不同纤维素富集条件下的多样性.试验采用羧甲基纤维素(CMC)培养基、蛋白胨纤维素(PCS)培养基、J培养基和K培养基分别在37和50℃条件下培养瘤胃内容物,使用PCR-DGGE技术、DGGE图谱共性及特异性条带的克隆和测序、聚类分析和主成分分析(PCA)几种方法分析瘤胃菌群多样性.结果表明:37℃条件下,不同培养基的DGGE图谱差异较大,J培养基和PCS培养基间的相似性系数为0.77;J培养基和CMC培养基间的相似性系数仅为0.76.50℃条件下不同培养基的DGGE图谱相似性较高,J培养基和PCS培养基间的相似性系数为0.78;而CMC培养基和PCS培养基间的相似性系数高达0.84.DGGE图谱中共性条带属于解没食子酸链球菌和解脲芽孢杆菌2个菌属,是瘤胃中的优势菌群;而主要的特异性条带属于解没食子酸链球菌、摩氏假单胞菌、产碱杆菌和未培养毛螺旋菌4个菌属.结果提示,不同纤维素富集培养基和温度对瘤胃菌群的多样性有一定程度上的影响.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	倪学勤	四川农业大学动物医学院	103	967	18.0	27.0
3	曾东	四川农业大学动物医学院	55	321	11.0	16.0
9	杨杰	四川农业大学动物医学院	9	45	3.0	6.0
10	曾燕	四川农业大学动物医学院	8	26	3.0	5.0
11	孙朋	四川农业大学动物医学院	2	4	1.0	2.0
12	张洪瑜	四川农业大学动物医学院	1	3	1.0	1.0