银杏GbGGPS基因的克隆及序列分析

• 作者: 张洪娟 曹福亮 谭碧玥
• 来源期刊: 南京林业大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 银杏萜内酯 牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶(GGPS) 蛋白质结构 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 8-12
• 页数: 5页
• 分类号: Q786
• 字数: 4403字
• 语种: 中文

摘要

利用RACE技术克隆并获得了银杏牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶基因(GbGGPS基因).银杏GbGGPS基因的cDNA全长为1 641 bp,含有1个1 176 bp的可读框,编码391个氨基酸序列.生物信息学预测GbGGPS蛋白的分子质量为42.51 ku,理论等电点为5.98,N端有叶绿体信号肽,其二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成.蛋白质同源分析表明,GbGGPS含有多聚异戊二烯基合成酶家族中保守的5个特征性结构域和2个富含天冬氨酸的区域.同源建模分析显示GbGGPS序列与薄荷GGPS蛋白的三维结构及活性位点高度相似.系统进化分析表明,银杏GGPS蛋白归属植物进化支,且与加拿大红豆杉、挪威云杉、北美冷杉的GGPS蛋白归为同一分支.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	曹福亮	南京林业大学森林资源与环境学院	325	4983	37.0	55.0
2	张洪娟	南京林业大学森林资源与环境学院	14	60	4.0	7.0
3	谭碧玥	南京林业大学森林资源与环境学院	6	124	5.0	6.0